تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیتی سخت پوست paramysis intermedia در مناطق تیاب و خلیج گواتر با استفاده از توالی یابی ژن میتوکندریایی 16srrna

Authors

سمیرا وحیدی نژاد

ایمان سوری نژاد

سعید تمدنی جهرمی

آرش اکبرزاده

فریبا کشاورزی

abstract

یکی از مهم ترین زئوپلانکتون هایی که در نواحی مصبی و دریایی مورد تغذیة آبزیان قرار می گیرد سخت پوست پارامایسیس اینترمدیا paramysis intermedia است. با توجه به وجود ذخایر این زئوپلانکتون در خلیج فارس و دریای عمان، آگاهی از ساختار ژنتیکی آن به منظور حفظ تنوع زیستی و خزانة ژنی دارای اهمیت است. در پژوهش حاضر برای اولین بار ساختار ژنتیکی و جمعیتی سخت پوست پارامایسیس اینترمدیا در دو منطقة تیاب و خلیج گواتر با استفاده از توالی یابی ژن 16s rrna میتوکندریایی بررسی شد. نتایج ده نمونة توالی یابی شده شامل 365 باز هم ردیف شدة ژن 16s rrna، 339 جایگاه ژنی مونومورف، 26 جایگاه ژنی پلی مورف و 27 موتاسیون نشان دهندة نرخ بسیار کم موتاسیون در این گونه بین مناطق مورد مطالعه بود. هیچ گونه چندشکلی اضافه و حذف مشاهده نشد. تعداد نه هاپلوتیپ در دو منطقه به دست آمد و میزان تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی برای تمامی نمونه ها بین دو منطقه به ترتیب 003/0 ± 978/0 و 000/0 ± 035/0 محاسبه شد. مقدار هتروزایگوسیتی مورد انتظار برای منطقة تیاب بیشتر (184/0 ± 287/0) از خلیج گواتر (088/0 ± 014/0) بود. مقدار fst در سطح احتمال 05/0 بین دو جمعیت 18/0 و معنی دار بود و در ترسیم درخت فیلوژنتیکی این جدایی به وضوح دیده شد. میانگین مقدار آزمون tajima's d و fu's fs بین دو منطقه به ترتیب 12/0- و 51/2 و غیر معنی دار بود که نشان دهندة نبود بسط جمعیتی بین نمونه های دو منطقه است. نتایج نشان داد که سخت پوست پارامایسیس اینترمدیا در دو منطقة مطالعه شده، به خصوص منطقة تیاب، از تنوع ژنتیکی بالایی برخوردار است و هر یک جمعیت مستقلی دارند.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیتی سخت پوست Paramysis intermedia در مناطق تیاب و خلیج گواتر با استفاده از توالی یابی ژن میتوکندریایی 16SrRNA

یکی از مهم‌ترین زئوپلانکتون‌هایی که در نواحی مصبی و دریایی مورد تغذیة آبزیان قرار می‌گیرد سخت‌پوست پارامایسیس اینترمدیا Paramysis intermedia است. با توجه به وجود ذخایر این زئوپلانکتون در خلیج فارس و دریای عمان، آگاهی از ساختار ژنتیکی آن به منظور حفظ تنوع زیستی و خزانة ژنی دارای اهمیت است. در پژوهش حاضر برای اولین‌بار ساختار ژنتیکی و جمعیتی سخت‌پوست پارامایسیس اینترمدیا در دو منطقة تیاب و خلیج گ...

full text

تنوع ژنتیکی گاماروس در رودخانه های شرق استان تهران با استفاده از توالی یابی ژن CO1 میتوکندریایی

خانواده گاماریده از شاخص ترین و متنوع ترین خانواده های راسته دوجورپایان هستند. دوجورپایان غذای اصلی بسیاری از گونه های ماهی هستند و نسبت به آلودگی محیطی حساسیت بالایی دارند، بنابراین دارای اهمیت اقتصادی و اکولوژیکی می باشند. به دلیل تفاوت در ویژگی های ریخت شناسی و اکولوژیکی گونه های مختلف، گام اول شناسایی گونه های آن هاست. جمع آوری و شناسایی گونه ای جنس Gammmarus در رودخانه های شرق استان تهران،...

full text

تنوع ژنتیکی میگوی سرتیز Metapenaeus affinis در خلیج فارس بر اساس توالی ژن میتوکندریایی 16S rRNA

میگوی سرتیز رتبه دوم میزان صید میگوی را در استان هرمزگان داشته و در چرخه صید و صیادی خلیج فارس اهمیت زیادی دارد. از این رو، بررسی تنوع ژنتیکی این گونه مهم مد نظر قرار گرفت. نمونه‌های میگو از سه منطقه بندرعباس، بوشهر و آبادان جمع‌آوری شدند و برای توالی‌یابی ژن میتوکندریایی 16S rRNA مورد بررسی قرار گرفتند. بهینه‌سازی واکنش PCR جهت تکثیر ژن انجام شد. نتایج توالی‌یابی ژن 16S rRNA که شامل 486 باز هم...

full text

بررسی مقدماتی فیلوژنی و ساختار ژنتیکی میگوی موزی (fenneropenaeus merguiensis) در خوریات لافت و سیریک خلیج فارس با استفاده از توالی یابی ژن میتوکندریایی ۱۶s rrna

میگوی موزی با نام علمی fenneropenaeus merguiensis از مهم ترین گونه های میگو در خلیج فارس است که حدود 60 درصد از صید میگوی استان هرمزگان را تشکیل می دهد. با توجه به اهمیت این گونه در چرخه صید و صیادی، فیلوژنی و ساختار ژنتیکی جمعیت این گونه در خوریات لافت و سیریک خلیج فارس با روش توالی یابی ژن میتوکندریایی 16s rrna بررسی شد. نتایج توالی یابی ژن 16s rrna 10 میگوی نمونه برداری شده که شامل 448 باز ه...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی ماهی سفید (Rutilus kutum (Kamensky, 1901 برخی از رودخانه های حوضه جنوبی دریای خزر با استفاده از توالی یابی ژن سیتوکروم b ژنوم میتوکندریایی (mtDNACytb)

در این بررسی 15 نمونه ماهی سفید (Rutilus kutum) از رودخانه های قره سو، گرگان رود (استان گلستان)، گهرباران، تجن و سفیدرود (استان مازندران) صید شدند. استخراج DNA با روش فنل-کلروفرم از بافت باله ماهیان انجام شد. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی ماهی سفید از ژن سیتوکروم b استفاده شد. تکثیر ژن سیتوکروم b با استفاده از پرایمرهای اختصاصی طراحی شده بر اساس توالی های موجود در بانک ژن صورت گرفت. طول 785 جفت ...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی میگو موزی (de man, 1888) fenneropenaeus merguiensis در خوریات لافت و سیریک با استفاده از توالی یابی ژن 16srrna میتوکندریایی

چکیده میگو موزی(de man,1888) fenneropenaeus merguiensis از مهم ترین گونه های میگو در خلیج فارس است که بیشترین میزان صید میگوی استان هرمزگان را به خود اختصاص می دهد. با توجه به اهمیت میگوی موزی در چرخه صید و صیادی، ساختار مولکولی و ژنتیکی جمعیت این گونه در خوریات لافت و سیریک برای اولین بار با استفاده از توالی یابی ژن میتوکندریایی 16srrna بررسی شد. استخراج dna با روش فنل-کلروفرم انجام شد و با ب...

15 صفحه اول

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
شیلات

Publisher: دانشکده منابع طبیعی دانشگاه تهران

ISSN 2008-5729

volume 68

issue 2 2015

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023